Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2B3Q16720 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2B3Q16720 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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