Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms