Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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