Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK4Q16566 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK4Q16566 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms