Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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VAMP3Q15836 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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VAMP3Q15836 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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VAMP3Q15836 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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