Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RAB35Q15286 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB35Q15286 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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