Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
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PTPRKQ15262 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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