Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R1Q15078 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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