Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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TRAM2Q15035 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAM2Q15035 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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