Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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