Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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