Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms