Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms