Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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