Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GOLGA4Q13439 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GOLGA4Q13439 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GOLGA4Q13439 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GOLGA4Q13439 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GOLGA4Q13439 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms