Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM28Q13263 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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