Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCB1Q12824 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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