Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms