Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 424.5 ms