Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms