Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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USP46P62068 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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USP46P62068 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP46P62068 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP46P62068 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP46P62068 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP46P62068 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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