Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms