Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms