Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HADHBP55084 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HADHBP55084 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HADHBP55084 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms