Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
TMPOP42166 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMPOP42166 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMPOP42166 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms