Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CTRLP40313 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms