Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms