Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP1P29466 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP1P29466 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms