Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2E1P29083 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms