Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms