Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms