Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BCKDHBP21953 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDHBP21953 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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