Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDSP20132 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDSP20132 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDSP20132 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDSP20132 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDSP20132 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDSP20132 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms