Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB8P17481 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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