Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC130P13994 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC130P13994 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms