Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA4P13612 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms