Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL6A2P12110 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL6A2P12110 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL6A2P12110 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms