Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CETPP11597 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CETPP11597 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CETPP11597 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms