Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MTHFD1P11586 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MTHFD1P11586 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms