Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTMAP06454 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTMAP06454 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTMAP06454 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTMAP06454 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTMAP06454 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTMAP06454 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTMAP06454 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms