Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGF1P05230 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGF1P05230 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms