Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAPGEF3O95398 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF3O95398 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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