Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms