Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEC22BO75396 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEC22BO75396 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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