Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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