Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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