Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR3AO14802 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms