Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms