Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms