Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms